Phytoplankton Species Composition, Abundance and Cell Size in San Francisco Bay: Microscopic Analyses of USGS Samples Collected 1992-2014

Evento de muestreo
Última versión publicado por United States Geological Survey el dic. 14, 2017 United States Geological Survey
Inicio:
https://www.sciencebase.gov/catalog/item/5a21caaae4b03852baf47459
Fecha de publicación:
14 de diciembre de 2017
Licencia:
CC0 1.0

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Descripción

This Data Release makes available measurements of phytoplankton species composition, abundance and cell size made on samples collected in San Francisco Bay (CA) from April 1992 through March 2014. Phytoplankton samples were collected at 31 stations along a 145-km transect where the variability of salinity, temperature, turbidity and nutrient concentrations reflected a broad range of environmental factors that regulate phytoplankton growth and abundance (map of sampling locations is available on the project website at: https://sfbay.wr.usgs.gov/access/wqdata/overview/wherewhen/stnmap.html). Whole water samples were preserved with acid Lugol’s solution, and 2 to 50 ml aliquots were settled in chambers for 6 to 24 hours (Utermöhl 1958). Phytoplankton cells were then counted and identified using a phase-contrast inverted microscope at 125x magnification, all cells greater than 30 μm diameter were enumerated. Cells smaller than 30 μm were counted at 1250x magnification; following the APHA (1989) strip count method, at least 100 cells of the most numerous taxon were counted. Cell volumes were estimated from measured linear dimensions and geometric formulas that varied with cell shapes. Phytoplankton samples representing 923 distinct date, station and depths were included. The 16,442 entries in this dataset include 609 different taxa within 11 functional groups. Diatoms dominated the total biovolume contributed by each functional group (77%) followed by dinoflagellates (14%) and cryptophytes (4.5%). The top 5 species contributing to the summed biovolume in all samples were: Thalassiosira punctigera, Chaetoceros socialis, Ditylum brightwellii, Thalassiosira rotula and Noctiluca scintillans. By frequency of occurrence, the top 5 species were: Teleaulax amphioxeia, Nannochloropsis spp., Plagioselmis prolonga var. nordica, Skeletonema costatum and Thalassiosira eccentrica.

Registros

Los datos en este recurso de evento de muestreo han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 932 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Event (core)
932
ExtendedMeasurementOrFact 
49326
Occurrence 
16442

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Nejad, E.S., Schraga, T.S., and Cloern, J.E., 2017, Phytoplankton Species Composition, Abundance and Cell Size in San Francisco Bay: Microscopic Analyses of USGS Samples Collected 1992-2014: U.S. Geological Survey data release

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es United States Geological Survey. En la medida de lo posible según la ley, el publicador ha renunciado a todos los derechos sobre estos datos y los ha dedicado al Dominio público (CC0 1.0). Los usuarios pueden copiar, modificar, distribuir y utilizar la obra, incluso con fines comerciales, sin restricciones.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 3c89212d-104e-43ef-913a-bc71592551ff.  United States Geological Survey publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF-US.

Palabras clave

Samplingevent

Contactos

James Cloern
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Senior (ST) Scientist
U.S. Geological Survey
  • Mail Stop 496, 345 Middlefield Road
94025 Menlo Park
CA
US
Abigail Benson
  • Usuario
  • Biologist
U.S. Geological Survey
Abigail Benson
  • Usuario

Cobertura geográfica

San Francisco Bay, California

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [37,472, -122,472], Latitud Máxima Longitud Máxima [38,152, -121,688]

Referencias bibliográficas

  1. Utermöhl, H. 1958. Zur Vervollkommnung der quantitativen Phytoplankton-Methodik. Mitt Int Verh Theor Angew Limnology 9:1-38. Not electronically available
  2. APHA. 1989. Standard methods for the examination of water and wastewater. 17th edn. American Public Health Association, Washington, DC. Not electronically available
  3. Hillebrand H, Durselen C, Kirschtel D, Pollingher U, Zohary T. 1999. Biovolume calculation for pelagic and benthic microalgae. Journal of Phycology 35:403–424. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1529-8817.1999.3520403.x/abstract
  4. Wetzel RG, Likens GE. 1991. Limnological Analyses. 2nd edn. Springer-Verlag, New York. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/rrr.3450070410/epdf

Metadatos adicionales