Phytoplankton Species Composition, Abundance and Cell Size in San Francisco Bay: Microscopic Analyses of USGS Samples Collected 1992-2014

Sampling event
Последняя версия опубликовано United States Geological Survey дек. 14, 2017 United States Geological Survey
Домой:
https://www.sciencebase.gov/catalog/item/5a21caaae4b03852baf47459
Дата публикации:
14 декабря 2017 г.
Опубликовано:
United States Geological Survey
Лицензия:
CC0 1.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 932 Записи в English (1 MB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (8 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (9 KB)

Описание

This Data Release makes available measurements of phytoplankton species composition, abundance and cell size made on samples collected in San Francisco Bay (CA) from April 1992 through March 2014. Phytoplankton samples were collected at 31 stations along a 145-km transect where the variability of salinity, temperature, turbidity and nutrient concentrations reflected a broad range of environmental factors that regulate phytoplankton growth and abundance (map of sampling locations is available on the project website at: https://sfbay.wr.usgs.gov/access/wqdata/overview/wherewhen/stnmap.html). Whole water samples were preserved with acid Lugol’s solution, and 2 to 50 ml aliquots were settled in chambers for 6 to 24 hours (Utermöhl 1958). Phytoplankton cells were then counted and identified using a phase-contrast inverted microscope at 125x magnification, all cells greater than 30 μm diameter were enumerated. Cells smaller than 30 μm were counted at 1250x magnification; following the APHA (1989) strip count method, at least 100 cells of the most numerous taxon were counted. Cell volumes were estimated from measured linear dimensions and geometric formulas that varied with cell shapes. Phytoplankton samples representing 923 distinct date, station and depths were included. The 16,442 entries in this dataset include 609 different taxa within 11 functional groups. Diatoms dominated the total biovolume contributed by each functional group (77%) followed by dinoflagellates (14%) and cryptophytes (4.5%). The top 5 species contributing to the summed biovolume in all samples were: Thalassiosira punctigera, Chaetoceros socialis, Ditylum brightwellii, Thalassiosira rotula and Noctiluca scintillans. By frequency of occurrence, the top 5 species were: Teleaulax amphioxeia, Nannochloropsis spp., Plagioselmis prolonga var. nordica, Skeletonema costatum and Thalassiosira eccentrica.

Записи данных

Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 932 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Event (core)
932
ExtendedMeasurementOrFact 
49326
Occurrence 
16442

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Nejad, E.S., Schraga, T.S., and Cloern, J.E., 2017, Phytoplankton Species Composition, Abundance and Cell Size in San Francisco Bay: Microscopic Analyses of USGS Samples Collected 1992-2014: U.S. Geological Survey data release

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является United States Geological Survey. Насколько это возможно по закону, издатель отказался от всех прав на эти данные и посвятил их Public Domain (CC0 1.0). Пользователи могут без ограничений копировать, изменять, распространять и использовать работу, в том числе в коммерческих целях.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 3c89212d-104e-43ef-913a-bc71592551ff.  United States Geological Survey отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF-US.

Ключевые слова

Samplingevent

Контакты

James Cloern
  • Originator ●
  • Point Of Contact
  • Senior (ST) Scientist
U.S. Geological Survey
  • Mail Stop 496, 345 Middlefield Road
94025 Menlo Park
CA
US
Abigail Benson
  • User
  • Biologist
U.S. Geological Survey
Abigail Benson
  • User

Географический охват

San Francisco Bay, California

Ограничивающие координаты Юг Запад [37,472, -122,472], Север Восток [38,152, -121,688]

Библиографические ссылки

  1. Utermöhl, H. 1958. Zur Vervollkommnung der quantitativen Phytoplankton-Methodik. Mitt Int Verh Theor Angew Limnology 9:1-38. Not electronically available
  2. APHA. 1989. Standard methods for the examination of water and wastewater. 17th edn. American Public Health Association, Washington, DC. Not electronically available
  3. Hillebrand H, Durselen C, Kirschtel D, Pollingher U, Zohary T. 1999. Biovolume calculation for pelagic and benthic microalgae. Journal of Phycology 35:403–424. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1529-8817.1999.3520403.x/abstract
  4. Wetzel RG, Likens GE. 1991. Limnological Analyses. 2nd edn. Springer-Verlag, New York. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/rrr.3450070410/epdf

Дополнительные метаданные

marine, harvest by iOBIS

Альтернативные идентификаторы https://www1.usgs.gov/obis-usa/ipt/resource?r=usgs_waterquality_sanfranciscobay_phytoplankton_1992_2014