Description
This Data Release makes available measurements of phytoplankton species composition, abundance and cell size made on samples collected in San Francisco Bay (CA) from April 1992 through March 2014. Phytoplankton samples were collected at 31 stations along a 145-km transect where the variability of salinity, temperature, turbidity and nutrient concentrations reflected a broad range of environmental factors that regulate phytoplankton growth and abundance (map of sampling locations is available on the project website at: https://sfbay.wr.usgs.gov/access/wqdata/overview/wherewhen/stnmap.html). Whole water samples were preserved with acid Lugol’s solution, and 2 to 50 ml aliquots were settled in chambers for 6 to 24 hours (Utermöhl 1958). Phytoplankton cells were then counted and identified using a phase-contrast inverted microscope at 125x magnification, all cells greater than 30 μm diameter were enumerated. Cells smaller than 30 μm were counted at 1250x magnification; following the APHA (1989) strip count method, at least 100 cells of the most numerous taxon were counted. Cell volumes were estimated from measured linear dimensions and geometric formulas that varied with cell shapes. Phytoplankton samples representing 923 distinct date, station and depths were included. The 16,442 entries in this dataset include 609 different taxa within 11 functional groups. Diatoms dominated the total biovolume contributed by each functional group (77%) followed by dinoflagellates (14%) and cryptophytes (4.5%). The top 5 species contributing to the summed biovolume in all samples were: Thalassiosira punctigera, Chaetoceros socialis, Ditylum brightwellii, Thalassiosira rotula and Noctiluca scintillans. By frequency of occurrence, the top 5 species were: Teleaulax amphioxeia, Nannochloropsis spp., Plagioselmis prolonga var. nordica, Skeletonema costatum and Thalassiosira eccentrica.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 932 enregistrements.
2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Nejad, E.S., Schraga, T.S., and Cloern, J.E., 2017, Phytoplankton Species Composition, Abundance and Cell Size in San Francisco Bay: Microscopic Analyses of USGS Samples Collected 1992-2014: U.S. Geological Survey data release
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est United States Geological Survey. En vertu de la loi, l'éditeur a abandonné ses droits par rapport à ces données et les a dédié au Domaine Public (CC0 1.0). Les utilisateurs peuvent copier, modifier, distribuer et utiliser ces travaux, incluant des utilisations commerciales, sans aucune restriction.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 3c89212d-104e-43ef-913a-bc71592551ff. United States Geological Survey publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF-US.
Mots-clé
Samplingevent
Contacts
- Créateur ●
- Personne De Contact
- Senior (ST) Scientist
- Utilisateur
Couverture géographique
San Francisco Bay, California
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [37,472, -122,472], Nord Est [38,152, -121,688] |
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Citations bibliographiques
- Utermöhl, H. 1958. Zur Vervollkommnung der quantitativen Phytoplankton-Methodik. Mitt Int Verh Theor Angew Limnology 9:1-38. Not electronically available
- APHA. 1989. Standard methods for the examination of water and wastewater. 17th edn. American Public Health Association, Washington, DC. Not electronically available
- Hillebrand H, Durselen C, Kirschtel D, Pollingher U, Zohary T. 1999. Biovolume calculation for pelagic and benthic microalgae. Journal of Phycology 35:403–424. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1529-8817.1999.3520403.x/abstract
- Wetzel RG, Likens GE. 1991. Limnological Analyses. 2nd edn. Springer-Verlag, New York. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/rrr.3450070410/epdf
Métadonnées additionnelles
marine, harvest by iOBIS