Descripción
Seawater was collected on board the NOAA ship Ronald H. Brown as part of the fourth Gulf of Mexico Ecosystems and Carbon Cycle (GOMECC-4) cruise from September 13 to October 21, 2021. Sampling for GOMECC-4 occurred along 16 coastal-offshore transects across the entire Gulf of Mexico and an additional line at 27N latitude in the Atlantic Ocean. We also collected eDNA samples near Padre Island National Seashore (U.S. National Parks Service), a barrier island located off the coast of south Texas. Vertical CTD sampling was employed at each site to measure discrete chemical, physical, and biological properties. Water sampling for DNA filtration was conducted at 54 out of 141 total sites and three depths per site (surface, deep chlorophyll maximum, and near bottom) to capture horizontal and vertical gradients of bacterial, protistan, and metazoan diversity across the Gulf.
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 311.390 registros.
también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Silliman K, Anderson S, Thompson L (2024). eDNA from Gulf of Mexico Ecosystems and Carbon Cruise 2021 (GOMECC-4). Version 1.7. United States Geological Survey. Occurrence dataset. https://ipt-obis.gbif.us/resource?r=noaa-aoml-gomecc4&v=1.7
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es United States Geological Survey. En la medida de lo posible según la ley, el publicador ha renunciado a todos los derechos sobre estos datos y los ha dedicado al Dominio público (CC0 1.0). Los usuarios pueden copiar, modificar, distribuir y utilizar la obra, incluso con fines comerciales, sin restricciones.
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 9012def0-bd87-48a0-ac9e-e0e78dd37689. United States Geological Survey publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF-US.
Palabras clave
Occurrence; Observation; ATLANTIC OCEAN (UUID: cf249a36-2e82-4d32-84cd-23a4f40bb393); GULF OF MEXICO (UUID: 75fab119-51a6-4b59-9711-f6c3cd3139db); Atlantic Oceanographic and Meteorological Laboratory; OAR; NOAA; U.S. Department of Commerce (UUID: 274cc3ed-e075-4fb3-89cd-51fa72bc64f9)
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
| Github Code Repo | https://github.com/aomlomics/gomecc Unknown R and Python code |
|---|---|
| NCBI BioProject | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA887898/ Unknown FASTQ |
Contactos
- Proveedor De Los Metadatos ●
- Autor ●
- Originador
https://orcid.org/0000-0001-5964-3965
- Autor ●
- Originador
- Autor ●
- Originador ●
- Punto De Contacto
Cobertura geográfica
Gulf of Mexico and south Atlantic Ocean
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [18,836, -97,639], Latitud Máxima Longitud Máxima [30,111, -79,618] |
|---|
Cobertura taxonómica
18S and 16S sequences assigned to Bacteria, Archaea, Chromista, Animalia, Plantae, Protozoa, and Fungi.
| Reino | Bacteria, Archaeae, Chromista, Animalia, Plantae, Protozoa, Fungi |
|---|
Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 2021-09-14 / 2021-10-20 |
|---|
Datos del proyecto
The effort was in support of the coastal monitoring and research objectives of NOAA’S Ocean Acidification Program. The cruise was designed to obtain a snapshot of key carbon, physical, and biogeochemical parameters as they relate to ocean acidification (OA) in the coastal realm. This was the fourth occupation of the Gulf of Mexico as part of the Ocean Acidification Program’s monitoring efforts, with the first three occurring in 2007, 2012 and 2017.
| Título | Gulf of Mexico Ecosystems and Carbon Cycle |
|---|---|
| Identificador | GOMECC |
| Fuentes de Financiación | NOAA/OAR Ocean Acidification Program Grant 21392, "Assessing ecosystem responses of Gulf of Mexico communities to OA using environmental DNA (or: Understanding biodiversity in the Gulf of Mexico using eDNA) http://dx.doi.org/10.13039/100018228 |
| Descripción del área de estudio | This report describes the fourth Gulf of Mexico Ecosystems and Carbon Cycle (GOMECC4) cruise on board the R/V Ronald H. Brown departing from Key West, FL into the Gulf of Mexico and then around the coastal waters of the Gulf of Mexico in a counter-clockwise direction. The cruise took place from September 13–October 21, 2021 |
| Descripción del diseño | The cruise included a series of 15 transects approximately orthogonal to the coast of the Gulf of Mexico and a 16th partial transect along the 27°N line, between Florida and the Bahamas, as well as a comprehensive set of underway measurements along the entire cruise track. In addition to these transects, three more stations were sampled as part of a collaboration with the National Parks Service to monitor ocean acidification at national parks. Four parks participated in this effort: Padre Island (in Texas), Dry Tortugas, Everglades, and Biscayne (these three in Florida). |
Personas asociadas al proyecto:
Métodos de muestreo
For more information see the cruise report: https://doi.org/10.25923/rwx5-s713
| Área de Estudio | For more information see the cruise report: https://doi.org/10.25923/rwx5-s713 |
|---|
Descripción de la metodología paso a paso:
- Detailed methods will be published in forthcoming paper. This field will be updated after publication.
Referencias bibliográficas
- Barbero, Leticia et al. "Cruise report: Fourth Gulf of Mexico Ecosystems and Carbon Cycle (GOMECC-4) Cruise", 2021 https://doi.org/10.25923/rwx5-s713
Metadatos adicionales
| Propósito | Implement eDNA sampling to better understand the impact of ocean acidification on marine life (bacteria to fish), develop models to predict indicator species and their responses to future climate scenarios, and inform ecosystem management strategies. |
|---|---|
| Identificadores alternativos | 9012def0-bd87-48a0-ac9e-e0e78dd37689 |
| https://doi.org/10.15468/sm6fpz | |
| https://obis.org/dataset/210efc7c-4762-47ee-b4b5-22a0f436ef44 | |
| https://ipt-obis.gbif.us/resource?r=noaa-aoml-gomecc4 |